Kanker: deze 4 genen helpen de uitkomst te voorspellen
Uitgebreid onderzoek naar de rol van de tumoronderdrukker p53 biedt een beter begrip van de genetische mutaties die spelen bij verschillende vormen van kanker, en identificeert vier genen die kunnen helpen bij het voorspellen van iemands vooruitzichten.
De TP53 gen is verantwoordelijk voor het coderen van wat wetenschappers tumoreiwit p53 noemen - een tumoronderdrukker die kan voorkomen dat cellen zich te snel delen en prolifereren.
Onderzoekers hebben nagesynchroniseerd TP53 de "bewaker van het genoom" vanwege zijn cruciale rol bij het voorkomen van tumoren en het onder controle houden van de celdeling.
Menselijke kankers vertonen vaak mutaties in de TP53 gen, waardoor een van de cruciale verdedigingsmechanismen tegen kanker faalt.
De eerste onderzoeken die identificeerden TP53 Mutaties in menselijke kankers verschenen in de jaren tachtig en sindsdien hebben onderzoekers veel tijd en middelen besteed aan het verduidelijken van de rol ervan bij kanker.
Nu gebruikt de grootste studie in zijn soort tumormonsters van meer dan 10.000 kankerpatiënten en kijkt naar 32 verschillende soorten kanker om de rol van kanker beter te begrijpen. TP53.
Dr. Larry Donehower, een professor in moleculaire virologie en microbiologie aan het Baylor College of Medicine in Houston, TX, leidde het nieuwe onderzoek, dat in het tijdschrift verschijnt Celrapporten.
Telltale 4-genen kunnen helpen bij het voorspellen van de vooruitzichten
Dr. Donehower en zijn team gebruikten vijf verschillende dataplatforms om 10.225 monsters van 32 kankers te extraheren. Met behulp van The Cancer Genome Atlas (TCGA) konden de onderzoekers de rol van de p53-route in deze 32 kankers uitgebreid beoordelen.
Dr. Donehower en zijn collega's vergeleken vervolgens de TCGA-gegevens met een andere database van 80.000 genetische mutaties die dr. Thierry Soussi - een professor in moleculaire biologie aan de Sorbonne Universiteit in Parijs, Frankrijk - over een periode van 30 jaar had verzameld.
Dat ontdekten de onderzoekers TP53 mutaties kwamen vaker voor bij mensen met een slechtere kijk. Bovendien bleek uit de analyse dat “Meer dan 91% van de kankers met TP53 mutaties tonen verlies van beide functionele TP53 allelen, ”of genvarianten.
Dr.Donehower legt uit: `` Bij sommige kankergenen zie je een kopie van de twee genen verloren of gemuteerd zijn '', maar `` meer dan 91 procent van alle kankers verliest beide genen. TP53 genen, niet slechts één. "
Het tweede allelverlies, schrijven de auteurs, vond plaats door "mutatie, chromosomale deletie of kopieerneutraal verlies van heterozygotie" - dat wil zeggen genduplicatie. De hoofdonderzoeker merkt ook op dat dit laatste proces veel vaker voorkwam dan ze eerder dachten.
Belangrijk is dat het onderzoek ook vier genen identificeerde die overexpressie vertoonden in mutanten TP53 tumoren. Volgens de onderzoekers kunnen deze vier genen "vertellen" of een kankerpatiënt een goede kijk heeft of niet.
"Als je een hoge expressie van die vier genen hebt, heb je een patiënt met een grotere kans op een slechte prognose [...] Omgekeerd, als die patiënt een zeer lage expressie van die genen heeft, zal hij waarschijnlijk langer overleven en een goede prognose. "
Dr. Larry Donehower
"Het geeft je een beter beeld van hoe het hem zal vergaan dan alleen te weten of hij mutant is TP53 of niet, ”vervolgt Dr. Donehower.
Ten slotte is de studie sterk geassocieerd TP53 mutaties met genomische instabiliteit, een bevinding die in overeenstemming is met TP53‘S typische rol als de" bewaker van het genoom. "
Dr. Donehower geeft commentaar op het unieke karakter van het nieuwe onderzoek door te zeggen: “De meeste studies over TP53 focus op één type kanker. "
"Als je naar 32 verschillende soorten kanker kijkt, zie je dat bepaalde patronen standhouden, ongeacht het type kanker."
Studie co-auteur en directeur van Cancer Genomics aan het Baylor College of Medicine, Dr. David Wheeler, geeft ook commentaar op het belang van de bevindingen.
Hij zegt: “Sinds TP53 is een van de belangrijkste poortwachters bij de preventie van kanker, hoe beter we dit gen begrijpen, hoe beter we in staat zullen zijn om de basisbiologie van kanker te begrijpen. Dat zal leiden tot betere therapieën. "
